Το μεταπτυχιακό πρόγραμμα σπουδών MSc in Ship Operation & Marine Safety αποτελεί φυσική συνέχεια αλλά και ουσιαστική διερεύνηση του αντικειμένου των προπτυχιακών προγραμμάτων.

Ταυτόχρονα αποσκοπεί στην βελτίωση και στη διεύρυνση των γνώσεων ατόμων με συναφές ακαδημαϊκό υπόβαθρο. Το πρόγραμμα μπορούν να το παρακολουθήσουν απόφοιτοι Ναυτικών και Ναυτιλιακών σπουδών που έχουν πρώτο πτυχίο ή BSc Degree σε ναυτιλιακή κατεύθυνση ή Άδεια Πλοιάρχου Α τάξης (Ε.Ν) ή Άδεια Α’ Μηχανικού (Ε.Ν). 

Η γλώσσα διδασκαλίας του προγράμματος είναι τα Αγγλικά και το πρόγραμμα προσφέρεται από το City Unity College σε συνεργασία με την Αραβική Ακαδημία Επιστημών, Τεχνολογίας και Θαλάσσιων Μεταφορών.